Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PKP4Q99569 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PKP4Q99569 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PKP4Q99569 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PKP4Q99569 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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