Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAT1Q99536 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms