Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD1Q99460 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms