Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC7Q96M83 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms