Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms