Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00526Q96FQ7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LINC00526Q96FQ7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms