Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHFRQ96EP1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms