Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLIP3Q96DZ5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms