Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C18orf8Q96DM3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms