Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUB2Q96DC9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms