Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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