Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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UBE2E3Q969T4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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UBE2E3Q969T4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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UBE2E3Q969T4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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UBE2E3Q969T4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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UBE2E3Q969T4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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UBE2E3Q969T4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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UBE2E3Q969T4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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UBE2E3Q969T4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2E3Q969T4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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