Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCAMP4Q969E2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms