Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EDAQ92838 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms