Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLHC1Q8NHS4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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