Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms