Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TTC16Q8NEE8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TTC16Q8NEE8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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