Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms