Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AVL9Q8NBF6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AVL9Q8NBF6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AVL9Q8NBF6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AVL9Q8NBF6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AVL9Q8NBF6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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