Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ANKRD42Q8N9B4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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ANKRD42Q8N9B4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD42Q8N9B4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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