Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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APLFQ8IW19 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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APLFQ8IW19 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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APLFQ8IW19 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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APLFQ8IW19 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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APLFQ8IW19 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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APLFQ8IW19 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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