Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERC6Q8IVU3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC6Q8IVU3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERC6Q8IVU3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms