Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ATG4DQ86TL0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATG4DQ86TL0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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