Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIG3Q6UXM1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms