Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
VSTM1Q6UX27 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms