Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNT1Q5JUK3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms