Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMER1Q5JTC6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms