Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms