Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
DUSP28Q4G0W2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP28Q4G0W2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms