Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL38Q2WGJ6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms