Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM71Q2Q1W2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms