Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSPP1Q1MSJ5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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