Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL24A1Q17RW2 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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