Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDO1Q16878 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms