Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TWIST1Q15672 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms