Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUM3Q15397 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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