Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CDK5R1Q15078 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms