Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCNIQ14094 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms