Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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COL4A6Q14031 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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COL4A6Q14031 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COL4A6Q14031 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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COL4A6Q14031 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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