Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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