Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RUNX3Q13761 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RUNX3Q13761 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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