Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MTMR3Q13615 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms