Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NAE1Q13564 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NAE1Q13564 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms