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| NAE1 | Q13564 | RCSD1-206 | ENST00000537350 | 3044 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | ATG4B-205 | ENST00000404914 | 2878 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | ABI3-201 | ENST00000225941 | 2109 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | DCUN1D3-201 | ENST00000324344 | 6162 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | ASIC4-202 | ENST00000358078 | 2741 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201 | ENST00000578492 | 2732 nt | TSL 2 BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | LRCH1-202 | ENST00000389797 | 3314 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | STRA6-207 | ENST00000535552 | 2631 nt | TSL 2 BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC00917-207 | ENST00000601556 | 2618 nt | TSL 2 BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | CCHCR1-208 | ENST00000451521 | 2587 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | BUD31-201 | ENST00000222969 | 1035 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU1-114P-201 | ENST00000365297 | 166 nt | BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | TEX26-AS1-201 | ENST00000411835 | 1203 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
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| NAE1 | Q13564 | SLC25A30-AS1-201 | ENST00000506633 | 701 nt | TSL 3 BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
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| NAE1 | Q13564 | RPL36-203 | ENST00000577222 | 874 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
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| NAE1 | Q13564 | RNASE4-203 | ENST00000555835 | 2520 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
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| NAE1 | Q13564 | COL11A2-202 | ENST00000361917 | 6104 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | RALGDS-202 | ENST00000372050 | 3634 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
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| NAE1 | Q13564 | MX1-210 | ENST00000455164 | 2810 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC004223.3-201 | ENST00000593039 | 1638 nt | APPRIS P5 TSL 2 BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
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| NAE1 | Q13564 | ERG28-201 | ENST00000256319 | 2633 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | REEP3-201 | ENST00000373758 | 5205 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | PITPNM1-216 | ENST00000534749 | 4189 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | TOM1L2-205 | ENST00000478943 | 2098 nt | TSL 2 BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | MBD4-204 | ENST00000503197 | 2099 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC058822.1-201 | ENST00000507166 | 2550 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.77 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | GNB2-202 | ENST00000393924 | 1524 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | TRIM7-203 | ENST00000393315 | 2851 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | ATP2B3-202 | ENST00000349466 | 4280 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | FKBP6-204 | ENST00000431982 | 1446 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | C12orf73-207 | ENST00000549478 | 1446 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | PITPNM3-201 | ENST00000262483 | 7086 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZFP41-203 | ENST00000520584 | 3284 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | STK40-204 | ENST00000373132 | 3621 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC00884-202 | ENST00000448892 | 2680 nt | TSL 5 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
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| NAE1 | Q13564 | MNX1-AS2-201 | ENST00000429228 | 374 nt | TSL 3 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
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| NAE1 | Q13564 | HMGB2-203 | ENST00000446922 | 1175 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | TMEM176B-206 | ENST00000492607 | 1265 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC02242-201 | ENST00000507298 | 641 nt | TSL 5 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC006449.3-201 | ENST00000620144 | 563 nt | TSL 4 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | FP236240.1-202 | ENST00000624019 | 601 nt | TSL 3 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | WDR45-230 | ENST00000634559 | 1192 nt | TSL 5 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL031056.2-201 | ENST00000637957 | 1217 nt | TSL 5 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | TMEM201-202 | ENST00000340381 | 3776 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | SRSF5-203 | ENST00000553521 | 2815 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | AKT1S1-205 | ENST00000391833 | 3640 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNF145-212 | ENST00000611185 | 3624 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | SHISA9-201 | ENST00000423335 | 4043 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | CLPTM1-202 | ENST00000541297 | 2732 nt | TSL 2 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | SF1-209 | ENST00000433274 | 2317 nt | TSL 2 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF497-201 | ENST00000311044 | 3468 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF586-201 | ENST00000391702 | 2265 nt | TSL 2 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF575-202 | ENST00000458714 | 2285 nt | TSL 2 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | SYNPO2L-202 | ENST00000394810 | 4921 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | ST7L-202 | ENST00000358039 | 4528 nt | TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | CAMLG-201 | ENST00000297156 | 2221 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | LMBRD1-202 | ENST00000370577 | 2209 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |
| NAE1 | Q13564 | KLHDC3-203 | ENST00000332245 | 1494 nt | TSL 2 BASIC | 14.76 | □□□□□ -0.05 | | |