Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CAMK2DQ13557 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CAMK2DQ13557 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms