Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms