Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TOP3AQ13472 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms