Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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AP3B2Q13367 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
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AP3B2Q13367 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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AP3B2Q13367 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP3B2Q13367 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP3B2Q13367 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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