Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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ITGB3BPQ13352 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGB3BPQ13352 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGB3BPQ13352 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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