Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms