Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMAN2Q12907 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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